科室介绍
生物样本库
又称生物银行(Biobank),主要是指标准化收集、处理、储存和应用健康和疾病生物体的生物大分子、细胞、组织和器官等样本(包括人体器官组织、全血、血浆、血清、生物体液或经处理过的生物样本(DNA、RNA、蛋白等)以及与这些生物样本相关的临床、病理、治疗、随访、知情同意等资料及其质量控制、信息管理与应用系统。 根据经济合作与发展组织(OECD)的定义,“生物样本库(Biobank)是一 种集中保存各种人类生物材料(Human biological material),用于疾病的临床治疗和生命科学研究的生物应用系统”。
生物样本库类型
生物样本库(Biobank)有多种类型,常见的组织、器官库(Tissue bank),如血液库、眼角膜库、骨髓库,到拥有正常细胞、遗传突变细胞、肿瘤细胞和杂交瘤细胞株(系)的细胞株(系)库,近年来出现了脐血干细胞库、胚胎干细胞库等各种干细胞库以及各种人种和疾病的基因组库(Genome bank)。 这些生物样本库(Biobank)为血液病、免疫系统疾病、糖尿病、恶性肿瘤等重大疾病的研究起到了非常重要的推动作用。
生物样本库主要形式 1、医院或研究机构下单个研究人员或者单个科室因其研究需要将其搜集的生物样本单保存而建立的生物样本库(Biobank); 2、医院或研究机构建立的生物样本库(Biobank),进行医院或研究机构内部搜集的生物样本资源统一保存和分配使用; 3、多个医院或研究机构联合组成的生物样本库(Biobank),实现各单位搜集的生物样本集中保存和共享使用; 4、第三方机构从社群中搜集大型的队列生物样本库(Biobank),集中保存并在申请审批后不同各研究人员提供样本。 因为不同类型生物样本库的存在,以及搜集样本的类型和保存方式的不同,其所承担的功能和架构、工作流程、基础设施建设和设备配备等情况也会不同。 生物样本库信息系统 生物样本库(Biobank)资源管理信息系统是为了便利于有效的管理生物样本和相关信息所建立的具有搜集、保存、检索和分析功能的信息系统。其易用性、安全性、可靠性是其重要考核内容。为此: 生物样本库(Biobank)资源管理信息系统的功能包括但不限于:追踪捐赠者的问卷和知情同意,管理生物样本采集、处理、储存和运输,管理QA/QC程序和文件,捐赠者临床数据电子采集,数据安全保护,报告管理(库存、采集、使用、QA等报告),临床和实验数据挖掘。 生物样本库(Biobank)资源管理信息系统应具有灵活的可扩展性,能适应和满足生物样本库不断发展和变化的需求。应定期评估信息系统确保其满足生物样本库工作需要和规范的要求。 生物样本库(Biobank)资源管理信息系统应能记录样本质量,如样本的储存温度环境和冻融次数等。 生物样本库(Biobank)资源管理信息系统应能通过标识(如条形码)将实物样本关联到信息系统中的相关数据。 识别和追踪样本 a) 提取、分装后的样本应能通过信息系统追溯到原始样本并与其信息相关联; b) 每份样本在信息系统中应有且仅有一个或者一组识别符号(数字或条形码); c)样本从采集到处理、储存、配送运输、使用后剩余返回重新储存等的全过程都应被有效记录; d) 生物样本的转移应被及时记录,信息系统能追溯到每一个样本储存位置的变更。 整体科研规划 即从短期、中期和长期三个阶段来规划本单位的科研目标,明确各个阶段可以采用的科研工具、相关的资源需求、人员配置等要素; 保存箱空间利用率 样本积累到一定数量后,手工方式查找和存放样本非常困难而且容易出错,存放样本的容器(例如冰箱、液氮罐)利用效率也会逐渐降低。因为一开始样本可能是分类顺序存放的,但是根据科研需求的不同,取样会从容器的不同位置取走样本,一段时间后,容器中会产生大量的零散空位却无法有效利用。这就需要利用信息化系统来进行样本存放位置的自动分配和查找,提高冰箱等容器的空间利用效率。 取样的准确性 这直接关系到实验结果和研究结论,有时却被忽视了。我们曾经听说过这样的事例:一个研究某种女性疾病的课题,提供了一批患者样本给商业服务机构进行基因分析,实验过程中却发现其中一些样本对应的患者是男性,这就使得这一批样本基本失去了价值。要避免这样的问题出现,可以通过已经很成熟的低温条形码标签技术,扫描条形码在软件工具中进行相关信息的核对,就能有效的确保取样的准确性。 配套临床资料的管理 收集和保存样本的目的是为了根据临床科研的需要,对病人的样本进行筛选,通过分子生物学实验得到患者外在症状和内在的基因、蛋白等表达之间的关联,如果一 份样本缺乏完整配套的临床资料,则筛选的依据不足,样本的科研价值就大打折扣了。 生物样本的质量控制 包括样本采集分装、入库、取样、出库整个过程中对样本质量的监控,避免样本出现污染、降解等质量问题;